Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms