Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gm20547B8JJN0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm20547B8JJN0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20547B8JJN0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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