Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clrn2B2RVW2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms