Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms