Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrn3B2RS91 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrn3B2RS91 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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