Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc2B2RR83 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms