Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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AU022751B1B0V2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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AU022751B1B0V2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU022751B1B0V2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU022751B1B0V2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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