Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms