Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd5B1AYB6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms