Protein–RNA interactions for Protein: B1AX39

Zcchc7, Zinc finger CCHC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc7B1AX39 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc7B1AX39 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc7B1AX39 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms