Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NhsB1AV60 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms