Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms