Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn3aA2ASI5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms