Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CerklA2AQH1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms