Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rtf1A2AQ19 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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