Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms