Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cavin4A2AMM0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms