Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms