Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm2A2A7B5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms