Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo47A2A6H3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms