Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l1A2A259 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms