Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms