Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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