Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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