Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms