Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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