Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm5538W4VSP6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm5538W4VSP6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5538W4VSP6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm5538W4VSP6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5538W4VSP6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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