Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms