Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms