Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms