Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms