Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubl3Q9Z2M6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubl3Q9Z2M6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubl3Q9Z2M6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubl3Q9Z2M6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubl3Q9Z2M6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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