Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Robo3Q9Z2I4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms