Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms