Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd3Q9Z2D8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms