Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms