Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap3b1Q9Z1T1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms