Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5Q9Z131 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms