Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmg20bQ9Z104 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmg20bQ9Z104 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms