Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn13Q9Z0S4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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