Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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