Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit3Q9WVB4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms