Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms