Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms