Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms