Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms