Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms