Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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