Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms