Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms